新技术揭示细胞核染色质的放射状结构

作者丨小柯

瑞典卡罗林斯卡学院Magda Bienko、Nicola Crosetto等研究人员合作利用GPSeq技术来揭示了细胞核中染色质的放射状结构。

这一研究成果于2020年5月25日在线发表在《自然—生物技术》上。

研究人员报道了通过测序进行基因座定位的方法（GPSeq），这是一种全基因组方法，可推断整个核半径上与核纤层的距离。

GPSeq依赖于从核纤层到核中心的染色质逐步限制性消化，然后对产生的切割位点进行测序。

使用GPSeq，研究人员以100 kb的分辨率绘制了人类基因组的径向组织图谱，从而揭示了基因组和表观基因组特征与基因表达以及A和B亚区室的径向模式。

通过结合径向信息和Hi-C测量的染色体接触频率，研究人员大大提高了全基因组结构建模的准确性。

最后，研究人员绘制了DNA双链断裂、生殖系变异和癌症突变的放射状拓扑图谱，并发现它们在A和B亚区室中具有独特的放射状排列。

研究人员认为，GPSeq可以揭示基因组结构的基本信息。

据悉，除了与核纤层相关的结构域外，哺乳动物细胞中染色质的放射状组织在很大程度上仍未知。

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